La chirurgie est l'une des options thérapeutiques dans le traitement des cancers. Au CGFL, les interventions sont pratiquées par une équipe de chirurgiens consacrant exclusivement leur activité à la chirurgie des cancers.
Ses spécialistes proposent également une chirurgie réparatrice et de reconstruction (microchirurgie, greffes autologues..), sans dépassement d'honoraires. Le Centre dispose également d'un service de chirurgie ambulatoire.